JRR-3に設置されている中性子散乱実験設備は、固体物理学、高分子科学、生物の領域で、物質構造の特徴を中性子ビームを使って調べることにより、 その物性や生理機能を解明する研究に利用されています。 これらの実験装置は、共同利用、協力、共同研究制度によって全国の国公私立大学や研究機関及び民間企業の研究者に共されています。

産業分野にも活発に利用され､創薬への応用、自動車エンジン内部の応力測定等、 さまざまな利用がなされています。